این کیت برای تشخیص کیفی آزمایشگاهی ژنهای ORF1ab/N/S ویروس کرونای جدید 2019-nCoV در نمونههای تنفسی شامل سوابهای اوروفارنکس، سواب نازوفارنکس، خلط و انجام همزمان تایپینگ جهش در HV69-70 del استفاده میشود. همانطور که در پایگاه داده GISAID گزارش شده است، بیش از 95٪ از توالیهای واریانت Omicron گزارش شده شامل یک حذف در HV69-70 هستند که میتواند باعث شکست هدف ژن S (SGTF) در سنجشهای PCR شود. SGTF میتواند به عنوان یک نشانگر جایگزین برای غربالگری Omicron استفاده شود.
مجموعههای پرایمر و پروب نشاندار شده با FAM برای تشخیص اختصاصی ژن آزمایشگاهی ORF ویروس کرونای جدید (2019-nCoV)، پروب نشاندار شده با VIC برای ژن N ویروس کرونای جدید (2019-nCoV)، پروب نشاندار شده با ROX برای جهش HV69-70 del ژن S ویروس کرونای جدید (2019-nCoV) طراحی شدهاند. ژن RNase P انسانی که همزمان با نمونه آزمایش استخراج میشود، یک کنترل داخلی برای اعتبارسنجی روش استخراج هسته و یکپارچگی معرف فراهم میکند. پروبی که ژن RNase P انسانی را هدف قرار میدهد، با CY5 نشاندار شده است.
سیستم PCR در زمان واقعی: Aehealth Diagenex AL، ABI 7500، ViiATM 7، Quant Studio 7 flex.Roche Lightcycler 480، Agilent Mx3000P/3005P، Rotor-GeneTM6000/0. Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P، MA 6000؛